تسعى وكالة الجامعة إلى تحقيق مجموعة من الأهداف تتمثل في:

·       التحسين المستمر للعمليات والخدمات الإدارية والمالية بمختلف الوحدات في الجامعة.

·       تطبيق الأنظمة الإلكترونية الحديثة بما يسهل التعاملات الإلكترونية بين وحدات الجامعة.

·       التحول الرقمي لتحسين جودة الخدمات المساندة المقدمة لمنسوبي الجامعة والمستفيدين.

·       التخطيط والاستثمار الأمثل للموارد البشرية والمالية المتاحة بالجامعة.

·       تطوير جميع قطاعات الجامعة الإدارية والخدمية والفنية.

·       تحقيق التميز في الإنشاءات الجامعية والتجهيزات العلمية بالجامعة .

·       تبسيط إجراءات العمل من خلال توظيف التكنولوجيا الإدارية.

·       تحقيق النزاهة والشفافية في العمليات الإدارية والمالية.

·       تحقيق كفاءة الطاقة، وتطوير منظومة الأمن السلامة بالجامعة.

·       تحقيق كفاءة الانفاق ، وتطوير نظام إدارة الأصول والعقود والمشتريات .